M. Axelson-Fisk – Comparative Gene Finding (Second edition, 2015)

1.220 ₽

Автор: M. Axelson-Fisk
Название книги: Comparative Gene Finding (Second edition)
Формат: PDF
Жанр: Биоинформатика
Страницы: 396
Качество: Изначально компьютерное, E-book

This book presents a guide to building computational gene finders, and describes the state of the art in computational gene finding methods, with a focus on comparative approaches. Fully updated and expanded, this new edition examines next-generation sequencing (NGS) technology. The book also discusses conditional random fields, enhancing the broad coverage of topics spanning probability theory, statistics, information theory, optimization theory and numerical analysis. Features: introduces the fundamental terms and concepts in the field; discusses algorithms for single-species gene finding, and approaches to pairwise and multiple sequence alignments, then describes how the strengths in both areas can be combined to improve the accuracy of gene finding; explores the gene features most commonly captured by a computational gene model, and explains the basics of parameter training; illustrates how to implement a comparative gene finder; examines NGS techniques and how to build a genome annotation pipeline.

Описание

Comparative Gene Finding — это фундаментальное руководство по методам поиска генов с использованием сравнительного анализа геномов. В книге подробно разбираются математические и алгоритмические основы современных инструментов, позволяющих выявлять гены в последовательностях ДНК с высокой точностью.

Автор рассматривает статистические модели (HMM, GHMM), алгоритмы динамического программирования, интеграцию данных из нескольких видов и машинное обучение. Второе издание обновлено с учётом достижений в области секвенирования нового поколения и появления новых подходов к аннотации геномов.

  • биоинформатикам и разработчикам инструментов для анализа геномов
  • студентам и исследователям в области вычислительной биологии
  • специалистам по NGS-данным, которым нужна теоретическая база
  • тем, кто хочет понимать принципы работы программ типа AUGUSTUS, GENSCAN и GlimmerHMM

Отзывы

Отзывов пока нет.

Только зарегистрированные клиенты, купившие данный товар, могут публиковать отзывы.